История Липецкого медицинского колледжа началась с создания в октябре 1930 года  Липецкого  медицинского политехникума. В годы Великой Отечественной войны Липецкий медицинский политехникум  переименован в Липецкую фельдшерско-акушерскую школу, которая в 1954 году переименована в Липецкое медицинское училище. Приказом Министерства здравоохранения и медицинской промышленности Российской Федерации от 18.10.1995 № 285 «О реорганизации Липецкого медицинского училища в колледж» Липецкое медицинское училище реорганизовано в государственное учреждение «Липецкий базовый медицинский колледж». В соответствии с приказом государственного учреждения «Липецкий базовый медицинский колледж» от 18.08.2003 № 293 «О внесении изменений в наименование образовательного учреждения» государственное учреждение «Липецкий базовый медицинский колледж» переименовано в государственное образовательное учреждение среднего профессионального образования «Липецкий  медицинский колледж».

Областное образовательное автономное учреждение среднего профессионального образования «Липецкий медицинский колледж» создано в соответствии с постановлением администрации Липецкой области от 01.04.2009 № 86 «О создании областного образовательного автономного учреждения среднего профессионального образования «Липецкий медицинский колледж» путем изменения типа существующего государственного образовательного учреждения среднего профессионального образования «Липецкий медицинский колледж».

В соответствии с Постановлением администрации Липецкой области от 17.09.2013 № 415 «О реорганизации областного образовательного автономного учреждения среднего профессионального образования «Липецкий медицинский колледж» областное образовательное автономное учреждение среднего профессионального образования «Липецкий медицинский колледж» реорганизовано в форме присоединения к нему государственного бюджетного образовательного учреждения среднего профессионального образования «Усманский медицинский техникум».

На основании приказа Управления здравоохранения Липецкой области от 16.04.2014  № 285 областное образовательное автономное учреждение среднего профессионального образования «Липецкий медицинский колледж»  переименовано в Государственное автономное профессиональное образовательное учреждение «Липецкий медицинский колледж».

Сегодня Липецкий медицинский колледж является центром медицинского и фармацевтического образования в регионе, ежегодно выпускающим более 300 высококвалифицированных специалистов среднего звена для учреждений здравоохранения.

Функции и полномочия Учредителя колледжа осуществляет Управление  здравоохранения Липецкой области